科研 | New Phytologist：土壤盐渍化在植物机动性的迭代选择中加速微生物群的稳定

互这两项作用和生命体体两组在土质中的的注记现型更为困难。因此，棍子据变种注记现型 (或其他可通过观察的近缘人等位蛋白质) 选取其所的土质生命体体两重新组合是一个很有欣赏力的术语。

在传统的变种杂交中的，即使不集中了解变种的蛋白质都是由，基于注记现型的年一般来说选取也可以增强所需要的等位蛋白质。然而，变种注记现型引导的选取对生命体体两组都是由和动态属性的遗传力就但会是完全各不相同的，因为选取不是看做单个等位蛋白质，而是许多等位蛋白质。此前人科学研究说明，生命体体两组形态的定向选取是合理的，但操作过程是未有知的。例如，在低CO2二氧化碳生命体体两组的选取确实随之而来了CO2的减小，短短时间内出现大量责难。选取要能变种注记现型 (如开小花短时间和存量) 时的结果与之十分相似。这些科学研究结果显示了生命体体两组动力的注记现型在选取后代间的详实转变，但这与后代间生命体体都是由的转变不匹配。因此，生命体体两组选取操作过程中的的注记现型变异此前提伴随着生命体体两组变异尚且未有知，而生命体体两组变异是注记现型转变的预想动力诱因。尽管在生命体体两组选取操作过程中的变种注记现型的转变往往很慌乱，但我们原计划提颇高土质威吓但会提颇高变种对土质生命体体的仰赖，从而随之而来来得加速和非常稳定的注记现型选取。

在本科学研究中的，我们旨在科学研究加灶土质和不加灶土质中的棍子都和都和统性生命体体两组的年一般来说选取是如何诱因变种注记现型的。我们在成熟芜青（Brassica rapa）栖息于32d后，将与棍子都和都和统性的生命体体两组集中于到新的消毒土质中的，并选取非常稳定的种子托同步进行播种（对变种蛋白质型未有同步进行选取），这一操作过程重复可用了6代。我们选取了芜青作为本科学研究的普通人，因为它曾在数值此前的生命体体两组选取科学研究中的被可用过。并且我们对在加灶有条件下栽种芸薹属（Brassica）变种有棍子本性热爱。在此此前的年一般来说式生命体体两组选取科学研究的基础上，我们将芜青的颇高存量生产作为一个注记现型，这也是一个都和统性的农耕等位蛋白质。我们运用于了3种选取检视：4个重复可用注记现型选取株都和，其中的生命体体群人落从最颇高存量植株的棍子部集中于; 在随机选取遏制中的，生命体体两组从随机选取的四个小花草中的集中于;而且，特别的是，本科学研究运用于加回遏制，即其中的牛痘的生命体体两组依然是第1代土质所可用的生命体体两组的加温版本。本科学研究运用于加灶和不加灶的选取来发生变化变种对土质生命体体的仰赖，以减轻威吓。科学研究论据生命体体两组的选取方式则也与变种存量的选取方式则也重合，并且在灶干扰下的选取来得非常稳定。

试验结果

1 变种安全性没有人随着短时间推移长时间改善

至少在6个栽种后代内，向不足之处栽种后代集中于颇高存量生命体体两组并没有人随之而来变种存量的长时间提颇高。比如说，变种存量的结果显现随机性（下图2；多余下图S1和多余下图S2）。在不加灶和加灶检视的G3、G4和G5以及G4和G5中的，变种存量比起加回遏制不具突出相异（多余注记S1、S2和S3）。然而，这些存量相异比起加回遏制整体提颇高也有减小。

下图1. 生命体体两组选取的样板。

下图2. 每代存量比起加回遏制的转变。上标如下下图，注记示相非常较非常的突出相异：***，P

2 选取随之而来生命体动植物减小

比如说，Shannon动植物（多余下图S3）的相异是由均匀度相异动力的（多余下图S4和多余注记S4）。总的来说，除了不加灶检视中的的芽孢都是由部份，随着栽种后代的提颇高，物种动植物呈下降趋势。数值得注意的是，加灶检视的芽孢动植物低于不加灶检视（多余注记S5）。加回遏制的G5和G6中的霉菌动植物比其他所有两组都颇高（多余注记S6和S7）。

3 与变种存量各不相同，生命体体的都是由在各不相同的后代中的依然各不相同于加回遏制

单个检视的离散聚类分析结果显示，加灶与否对芽孢和霉菌的成分有突出诱因（下图3；多余注记S8）。后代也与都是由突出都和统性（多余注记S8），生命体体都是由逐渐忽略G1中的的都是由（下图3）。加灶与否解读了相比之下来得多的芽孢都是由相异（R2=0.31），而各不相同后代的相异解读了来得多的霉菌都是由相异（R2=0.29）。

下图3. 芽孢（16S rRNA蛋白质）和霉菌（ITS区域）都是由随短时间和加灶与否的PCoA栖息于。试样按后代拆分颜色，圆锥形与灶检视相比之下不宜。加回对不宜试样不具新颖的圆锥形（空心三角形注记示无灶，上标注记示灶），尽管选取都和充分发挥作用代际相异，所有的加回对不宜在G2之此前聚集到了一同。G1土质来自农作（仅限于加回对不宜）。

棍子据各不相同后代来分析生命体体都是由时，除G1部份，所有后代的生命体体都是由相非常较上都充分发挥作用突出相异（多余注记S9）。由于G1土质来自农作，我们原计划没有人生命体体都是由相异，但在不加灶检视中的，我们确实通过观察到了芽孢都是由的相异。随机选取对不宜变种和注记现型选取变种错综有用的相异主要注记现在芽孢都是由而非霉菌都是由上。反之亦然的，加回对不宜变种和等位蛋白质注记现型选取变种错综有用的生命体体都是由没有人突出相异（多余注记S10和S11）。与随机选取对不宜变种和注记现型选取变种（G6中的的R2平均数值=0.34）相非常，加回对不宜变种和注记现型选取变种错综有用的非常解读了来得多的生命体体都是由相异（G6中的的R2平均数值=0.60），这就但会说明生命体体都是由与加回对不宜变种错综有用充分发挥作用相异。

为了揭示加回对不宜中的生命体体成分的就但会相异，我们提炼了加回对不宜与每代内所有选定变种的Bray Curtis相异（下图4）。生命体体都是由在各代错综有用与加回对不宜的相异越来越大（多余注记S12）。G6中的，与芽孢都是由相非常，霉菌都是由与相不宜的加回对不宜来得不十分相似（下图4）。霉菌成分的不十分相似性随短时间递减趋势，而芽孢成分的不十分相似性最初递减趋势，然后趋于保持稳定（不加灶）或稍微下降（加灶）。

下图4. 与加回遏制都和统性的生命体体都是由相异。每代提炼加回对不宜变种和都将变种错综有用的Bray Curtis相异。原始数据用多项式弧线插图。由于G1期的土质来自农作，我们不期望世代的相异性有所各不相同。P数值：***=

为了明确哪些颇高等自始定群人随之而来了加回遏制与注记现型选取都和和随机选取遏制错综有用的相异，我们插图了颇高等自始定群人的线性每一次（多余下图S5、多余下图S6和多余下图S7）。举例来说，随着短时间的推移，芽孢门的相比之下稀土元素开始同类，这可以解读芽孢都是由原始数据中的Bray-Curtis相异性的保持稳定和下降。在不加灶检视中的，Ascomycota中的一种未有自始定纲的相比之下稀土元素大大忽略加回对不宜，再现了Bray-Curtis不十分相似霉菌都是由的相异方式则也（下图4）。在加灶检视中的，这种相异可以用此前后代的Saccharomycetes和后后代的Sordariomycetes来解读。我们通过将注记现型选取都和与加回对不宜非常，同步进行相异稀土元素验证，以明确由注记现型选取都和（多余注记S13、S14和S15）选取或配对的OTU。不考虑灶的诱因，我们鉴定了32个芽孢OTU和10个霉菌OTU，它们在通过注记现型选取都和的年中选取方面展现出突出中的性。相非常之下，在年中选取操作过程中的，17个芽孢OTU和17个霉菌OTU被突出去除丢出。灶改性检视的中的性选取生命体体数量较多，有19个芽孢OTU和7个霉菌OTU，而在无灶检视中的选取了13个芽孢OTU和3个霉菌OTU。我们通过观察到注记现型选取都和和随机选取对不宜错综有用的OTU没有人突出相异。此部份，我们通过网络分析明确了与分两组注记现型选取都和突出原则上的6个属（多余注记S16）。寻常的是，第4代和第5代的都和统性性无论如何与每个自始定单元反之亦然，这说明在这些后代中的，变种去除的这两项作用就但会来得强。

讨论

气候区动力的土质灶碱化原计划但会激化集中的政府机构土地和自然有条件下的整体灶碱化原因。在农耕多样性中的，大幅提颇高我们在颇高灶土质中的栽种水稻（如芸薹属Brassica变种）的很难以适不宜日益激化的土质灶碱化是一个棍子本性的基础理论。生命体体对耐灶性的杰出贡献就但会是由生命体体两组中的许多自始定群人的除此以外杰出贡献动力的。选取耐灶动态的方法就但会需要要同时针对许多自始定群人及其相互这两项作用的方法，这使得以发生变化生命体体两组动态为要能的生命体体两组操控已是农耕中的一个欣赏人的术语。近来许多科学研究将生命体体都是由与变种注记现型形态联都和起来，说明生命体体两组的人工选取就但会很难以一种可论据的方式则发生变化变种注记现型。经证明，这种方法但会诱因变种存量、干旱威吓恢复力和变种开小花短时间。然而，生命体体两组形态的人工选取此前提随着短时间的推移而非常稳定，或者生命体体都是由的每一次此前提与变种注记现型形态的转变重合，现阶段尚不确切。关于在其都将取土质生命体体两组时的代际转变只有零星引述。

在注记现型选取都和和随机选取对不宜中的，我们通过观察到加回对不宜的生命体体都是由原则上且接近线性相异。生命体体都是由的相异就但会是由必要在变种棍子和棍子际定殖的中的性、中的性和有害生命体体的年中选取所动力的，与通过观察到的变种注记现型的相异选取反之亦然。随机选取对不宜变种和注记现型选取变种（即相异稀土元素验证）错综有用的一些OUT的突出缺乏有利于引人注意说明，我们就但会自始在获取棍子际适生生命体体。在加灶有条件下，芽孢的选取无论如何比在不加灶有条件下来得迟地趋于非常稳定（下图4），这说明在加灶有条件下，必要生命体体的变种选取引发得来得迟。与此对不宜，相异稀土元素验证还明确了来得多的OTU，这些OTU在加灶有条件下被积极选取。灶威吓也来得多地解读了芽孢都是由比起霉菌都是由的β动植物相异，说明土质灶渍化在芽孢去除中的起着来得大的这两项作用。

在我们的自适不宜中的，我们假定生命体体两组选取包含两个先决条件，这两个先决条件南至北引发：

（i）对棍子际适不宜生命体体的长时间配对，以及（ii）对特定注记现型的长周期性自始选取。灶碱有条件下芽孢来得加速非常稳定的选取趋势（下图4）说明，第1个选取先决条件主要通过6代已完成，比如说来得长的选取操作过程但会随之而来来得显着的注记现型选取。

寻常的是，虽然土质生命体体两组选取对变种安全性有各不相同的诱因，但我们通过观察到，在加灶或不加灶有条件下，变种存量与随机或要能生命体体两组选取错综有用没有人显着的自始都和统性，尽管某些后代中的变种存量颇高于加回遏制。此此前的科学研究说明，基于反之亦然的注记现型（如早小花与晚小花）或选取有条件（如低或颇高湿气利用率）选取生命体体两组可以造成对变种栖息于诱因各不相同的生命体体两组。我们的科学研究说明，至少在短期内，选取与颇高安全性变种都和统性的生命体体两组和选取与随机选取的落叶都和统性的生命体体两组错综有用没有人显着相异。由于我们下半年的生命体体两组取样，我们只关心此前6代的选取，但通过生命体体两组选取通过观察到的变种等位蛋白质的自始向选取均在3到5代错综有用。虽然我们论据注记现型选取在加灶检视中的来得加原则上，但由于变种选取心理压力的提颇高，存量的大幅提颇高在两种灶检视中的同样不原则上。今后同步进行生命体体两组选取科学研究的一个考虑诱因是土质中的初始牛痘物的选取。在我们的科学研究中的，我们可用低灶土质作为不西北面显着的灶压下的中的性牛痘源，以避开灶改检视中的的生命体体选取偏差。我们的要能是使牛痘物已是一个不被农作水稻栽种突出诱因的多样化生命体体“种子托”。然而，我们承认牛痘源对于选取操作过程中的其所近缘人/动态的初始招揽颇为重要，并且将是今后科学研究的重要方向。

与那时候的科学研究各不相同的是，我们可用了6个解码注记现型选取都和、1个随机选取对不宜和一个加回对不宜。加回对不宜的可用为生命体体两组都是由和跨代变种注记现型转变缺少了一个可靠的固定不动，这优于此此前涉及多个变种栖息于长周期的选取试验的常规。即使在颇高度遏制的栖息于四楼中的，变种栖息于的均数值也但会在相当大总体上受到高温和水蒸气pH等诱因的诱因。各不相同代间加回遏制（刚刚初始生命体体两组牛痘在G2最后的消毒土质）生命体体两组的显着聚类，说明冰冻和再次牛痘土质是一种必要的解码土质生命体体两组分的方法，甚至在冰冻最后8个月依旧可以必要解码（下图3）。芥菜叶层的冰冻牛痘物生命体体两组都是由的复建有利于支撑了这一观点。

结论

近年来，为了大幅提颇高变种适不宜性，人们对生命体体政府机构和生命体体两组操控的热爱势头提颇高。本科学研究的原始数据说明，在选取的更早先决条件，通过生命体体两组的集中于来选取变种注记现型是不应论据的。尽管变种注记现型的每一次不应论据，但我们通过观察到，生命体体都是由比起加回遏制充分发挥作用相符合线性的相异，这就但会是由棍子际适不宜性生命体体的获取所动力的。生命体体都是由的这种巨大相异说明，无意识的生命体体选取就但会但会在农耕多样性中的迅速引发，特别是在重复可用栽种十分相似蛋白质型水稻的田地中的。棍子际生命体体的都是由在各不相同的变种类型中的往往是新颖的，因此一种特定水稻棍子际适不宜性生命体体的获取对生命体体政府机构和养牛都有诱因。科学研究灶碱有条件下变种生命体体的多余对于忽略世自始各地气候区转变如何诱因变种与生命体体的关都和至关重要。我们通过观察到，在灶碱有条件下，变种对芽孢都是由的去除很难比霉菌来得强。我们的原始数据说明，灶碱化就但会但会诱因可供人变种多余的芽孢托，并就但会有利于激化农耕多样性中的常见生命体体动态的耗竭。

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